Ondanks de voordelen zijn er ook duidelijke beperkingen aan deze siliconen kolommen. Het grootste nadeel is dat ze geen fijne, mechanische afstelling bieden zoals traditionele schroef- of micrometernivelleringen. Siliconen heeft een zekere compressie onder belasting, dus voor toepassingen die micron-nauwkeurigheid of herhaalbare, vastgestelde hoogtes vereisen, is dit geen vervanging voor verstelbare hardware.
Daarnaast kan compatibiliteit een issue zijn: niet alle printers en bedmontages hebben ruimte of geschikte bevestigingspunten om deze kolommen effectief te plaatsen. Omdat de productbeschrijving geen exacte afmetingen of toleranties opgeeft, moet je soms experimenteren met positie en aantal om het gewenste resultaat te bereiken. Ook bestaat het risico dat bij extreem hoge belastingen of langdurige druk de kolommen op den duur enigszins vervormen of verzadigen, wat opnieuw bijsturing vereist.
Tot slot ontbreken er markeringen of maatvoering op de kolommen, wat betekent dat nauwkeurige, proportionele plaatsing lastiger is. Voor gebruikers die op zoek zijn naar een one-time, nauwkeurige calibratie-oplossing of een professionele, vastgezette montage zijn mechanische alternatieven vaak betrouwbaarder. Deze siliconen zijn het meest geschikt als ondersteunende, dempende en tijdelijke correctie, niet als permanente precisiecomponent.